Díky poloze 6° jižně od rovníku panuje na Zanzibaru tropické podnebí. Nejteplejšími měsíci jsou leden až březen, kdy se teploty vzduchu pohybují okolo 32 – 33 °C, v dubnu až červnu je 31 – 29 °C. „Nejchladněji“ je v červnu až červenci, s teplotami kolem 28 °C, v září a říjnu teploty stoupají na 29 – 30 °C a v listopadu a prosinci na 31 – 32 °C. Od dubna do května panuje na ostrově období dešťů.
Za optimální měsíce pro návštěvu jsou považovány červen až říjen, ale Evropané upřednostňují leden až březen. V dubnu a květnu je část hotelů uzavřená z důvodu pravidelných rekonstrukcí.
| Měsíc | 1. | 2. | 3. | 4. | 5. | 6. | 7. | 8. | 9. | 10. | 11. | 12. |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Průměrná teplota vzduchu (°C) | 32 | 32 | 33 | 31 | 29 | 29 | 28 | 28 | 29 | 30 | 31 | 32 |
| Průměrná teplota vody (°C) | 27 | 28 | 28 | 28 | 28 | 28 | 27 | 27 | 27 | 27 | 27 | 27 |
| Průměrné měsíční srážky (mm) | 58 | 66 | 147 | 320 | 290 | 53 | 28 | 30 | 41 | 66 | 170 | 140 |
